2016年9月20日,鹰君药业荣获“厦门市最具影响力优秀民营科技企业”称号,厦门市仅15家企业获此殊荣。近年来,鹰君药业加大科研投入,先后与厦门大学药学院、福建农林大学作物科学学院、福建师范大学生命科学学院、福建省农科院、浙江省农科院和福建亚热带植物研究所等“五院一所”进行产学研合作,取得了23项国家专利,先后被评为国家高新技术企业、国家知识产权优势企业等。